MEGA:系统树(进化树)的构建
主要用于进化分析获得的序列信息。通过它可以编辑序列的数据、进行序列的比对、构建系统发育树和推测对比物种序列间的关联程度及进化距离等。
操作方法
(01)首先在NCBI等文献搜索软件中搜索目的序列,此处以端粒telomere为例,打开其中一个搜索结果
(02)点击右边的Run BLAST进行比对
(03)注意,如果此处输入的是序列,右边的序列比对范围无法设定,如果是编号可以设置,这里我设置的是从1到200个核酸比对
(04)比对的结果及其详细信息就是下面这样(三幅图是连在一起的)。这里我选择了前十个对比序列
(05)在Donwload下设置下载的文本格式,点击Continue进行下载,设置好储存路径。保存好以后将文本打开,格式设置为自动换行
(06)打开MEGA,创建比对框。根据自己的需要选择选项,点击OK。如果需要比对的是核酸,点击DNA,如果是蛋白质点击Protein
(07)点击比对框中Edit菜单下的Insert Sequence From File;选择自己之前下载的序列格式,因为我刚才的是Text文本格式,所以这里我选择Text(注意:如果格式不正确,则之前保存的序列不会出现)。选好格式后,自己的核酸序列文本显示出来,点击后打开
(08)打开后MEGA进行序列比对分析,根据比对结果可通过Edit对序列进行编辑
(09)分析好后点击Date菜单下的Phylogentic Analysis进行构象树分析
(10)然后在主菜单上点击Analysis点击Phylogeny,在选择第二个选项并确定。点击Compute进行比对构建构象树
(11)下面是比对的结果
-
独角兽真的存在吗?独角兽的十大来历和传说
导语:有没有想过独角兽是真的?这只强大的野兽只是个神话吗?古往今来,有很多人在问世界上真的有独角兽吗?独角兽有什么特殊含义?之前小编为大家讲解过世上有龙的十大证据,接下来呢就为大家揭秘独角兽的十大来历和传说,感兴趣的不妨一起往下看!独角兽的十大来历和传...
-
电脑没有声音怎么调出来
(01)电脑没有声音可能是因为多种原因,例如音量设置为静音、音频设备未连接、驱动程序问题等。下面是一些可能的解决方案:1.检查音量设置:在任务栏右侧找到音量图标,单击并将鼠标指针悬停在音量调节器上。(02)然后尝试调整音量,看看是否有声音输出。2.检查音频设备:确保耳...
-
一个比特币值多少人民币?2019突破55285元(最高137177元)
导语:比特币是一种加密的虚拟数字货币,在2017年12月17日曾达到历史最高价19850美元,但是在2017年9月4日,央行表示禁止虚拟货币的交易,并且比特币在中国是没有法律上的货币地位,不过据国外报价表明,在2019年5月14日,比特币的价格已经再创新高,突破了8000美元,也就是人民币...
-
酒能寄快递吗
(01)酒在寄快递方面需要考虑以下因素:1.国家法律法规:不同国家对于寄送酒类的规定存在差异,一些国家可能允许寄送酒类,但也有些国家可能禁止或限制寄送酒类。(02)在寄送酒类之前,需要先了解目的地国家的法律法规和邮寄政策。2.邮寄公司政策:邮寄公司通常有自己的规定和限...